Коринебактерии

Синегнойная палочка (Pseudomonas aeruginosa)

Классификация

Большинство видов коринебактерий являются нелиполитическими, то есть неспособными разлагать жир. Липолитические (липофильные) микроорганизмы могут расти и размножаться в липидах. Нелиполитические бактерии подразделяются на ферментирующие и неферментирующие:

• Нелиполитические коринебактерии
  • Ферментирующие коринебактерии:
    • Corynebacterium argentoratense
    • Corynebacterium amycolatum
    • Corynebacterium diphtheriae
    • Corynebacterium glucuronolyticum
    • Corynebacterium striatum
    • Corynebacterium matruchotii
    • Corynebacterium minutissimum
    • Corynebacterium xerosis
  • Неферментирующие коринебактерии:
    • Corynebacterium afermentans subsp. afermentans
    • Corynebacterium auris
    • Corynebacterium pseudodiphtheriticum
    • Corynebacterium propinquum
• Липолитические (липофильные) коринебактерии

  • Corynebacterium accolens
  • Corynebacterium afermentans subsp. lipophilum
  • Corynebacterium bovis
  • Corynebacterium jeikeium
  • Corynebacterium macginleyi
  • Corynebacterium urealyticum
  • Corynebacterium uropygiale

Пропионибактерии акне (Propionibacterium acnes)

Геномика

Сравнительный анализ геномов коринебактерий привел к идентификации нескольких консервативных инделей сигнатур , уникальных для этого рода. Двумя примерами этих консервативных сигнатурных инделей являются вставка из двух аминокислот в консервативной области фермента дифосфата фосфорибозы: декапренилфосфатфосфорибозилтрансфераза и вставка из трех аминокислот в ацетаткиназу , обе из которых обнаружены только у видов Corynebacterium. . Обе эти индели служат молекулярными маркерами для видов рода Corynebacterium . Кроме того, были идентифицированы 16 консервативных сигнатурных белков, которые уникально обнаружены у видов Corynebacterium . Три консервативных сигнатурных белка имеют гомологи, обнаруженные в роду Dietzia , который, как полагают, является ближайшим родственным родом к Corynebacterium . В филогенетических деревьях, основанных на конкатенированных белковых последовательностях или 16S рРНК, род Corynebacterium образует отдельную кладу, внутри которой находится отдельный субклад, кластер I. Кластер состоит из видов C. diphtheriae, C. pseudotuberculosis, C. ulcerans, C. aurimucosum, C. glutamicum и C. efficiens . Этот кластер отличается несколькими консервативными сигнатурами, такими как вставка из двух аминокислот в LepA и вставка из семи или восьми аминокислот в RpoC. Кроме того, 21 консервативный сигнатурный белок обнаружен только в членах кластера I. Был предложен еще один кластер, состоящий из C. jeikeium и C. urealyticum , что подтверждается наличием 19 различных консервативных сигнатурных белков, уникальных для этих двух видов. . Коринебатерии имеют высокое содержание G + C в пределах 46-74 мол.%.

Описание

Антитела к микоплазме lgG, Mycoplasma hom. IgG количественный — позволяет выявить IgG антитела к бактериям Mycoplasma hominis.Микоплазмы — это группа внутриклеточных микроорганизмов — грамотрицательных бактерий, которые обитают на растениях и в организме животных и человека.
В организме человека обитают 16 видов микоплазм. Из них 6 видов обитают на слизистых половых органов и мочевых путей; остальные 10 видов — во рту и глотке. Размер этих бактерий 115–200 нм. Они не имеют плотной клеточной стенки, покрыты трёхслойной цитоплазматической мембраной.Mycoplasma hominis — группа микоплазм, вызывающих поражения урогенитального тракта у мужчин и женщин. Это условно патогенные микроорганизмы, иначе говоря они являются одним из компонентов нормальной бактериальной микрофлоры слизистых оболочек мочевыводящих путей здорового человека, но при снижении иммунитета и превышении определённой пороговой концентрации микроорганизмов они могут стать причиной воспалительных заболеваний урогенитального тракта. Микоплазмы характеризуются полиморфизмом и своеобразным жизненным циклом.
Источником инфекции является человек, больной микоплазмозом, или здоровый носитель микоплазм. Инфекция может долгое время протекать скрыто, или проявиться под воздействием различных факторов, например вследствие гормональных изменений, понижения иммунитета и присоединения сопутствующих инфекций.
Микоплазменные инфекции урогенитального тракта занимают одно из ведущих мест среди ИППП. Они часто сочетаются с гонококками, трихомонадами и условно-патогенными микроорганизмами, передаются при половых контактах, могут являться причиной негонококкового уретрита и простатита, воспалительных заболеваний малого таза, патологии беременности и плода, бесплодия у женщин и мужчин, а также перинатальной инфекцией новорождённых.Клиническая картина при микоплазменной инфекции
Клинические проявления микоплазменной инфекции различные, что связано с анатомическими особенностями строения женских и мужских половых органов. Для мужчин характерно проявление уретрита или простатита, сопровождающихся зудом, жжением и учащенным, болезненным мочеиспусканием. Для женщин — развитие микоплазменного вагинита или цервицита, которые проявляются зудом, жжением, чувством дискомфорта внизу живота и в области гениталий, слизистыми выделениями из половых путей, болью при половом акте.
Длительная хроническая микоплазменная инфекция может привести к патологии беременности и даже к бесплодию. Возможна передача инфекции и от матери к ребёнку — трансплацентарно во время беременности, или в процессе родов. При этом микоплазменная инфекция у новорождённого проявляется в виде менингита, септицемии и инфекций дыхательных путей.Антитела при микоплазменной инфекции
В ответ на инфицирование микоплазмой иммунная система начинает вырабатывать ряд специфических иммуноглобулинов: IgA, IgM и IgG. Выработка IgG к Mycoplasma hominis начинается примерно через 2–4 недели после инфицирования, и продолжается на протяжении длительного времени: до года и более. Наличие в крови иммуноглобулинов класса G к Mycoplasma hominis говорит о наличие острого или о перенесённом в прошлом заболевании, а также о реинфекции и хроническом воспалительном процессе.Показания: 

• в комплексе исследований при негонококковом уретрите у мужчин;
• воспалительные заболевания органов малого таза;
• бесплодие у женщин;
• эпидемиологический скрининг.

Подготовка
Кровь рекомендуется сдавать утром, в период с 8 до 12 часов. Взятие крови производится натощак, спустя 4–6 часов голодания. Допускается употребление воды без газа и сахара. Накануне сдачи исследования следует избегать пищевых перегрузок.Интерпретация результатов
Единицы измерения: УЕ*
Положительный результат будет сопровождаться дополнительным комментарием с указанием коэффициента позитивности пробы (КП*):

• КП >= 11,0 — положительно; 
• КП <= 9,0 — отрицательно;
• КП 9,0–11,0 — сомнительно.

*Коэффициент позитивности (КП) — это отношение оптической плотности пробы пациента к пороговому значению. КП — коэффициент позитивности, является универсальным показателем, применяемым в иммуноферментных тестах. КП характеризует степень позитивности исследуемой пробы и может быть полезен врачу для правильной интерпретации полученного результата. Поскольку коэффициент позитивности не коррелирует линейно с концентрацией антител в пробе, не рекомендуется использовать КП для динамического наблюдения за пациентами, в том числе контроля эффективности лечения.

Вагинальная экосистема – состав микрофлоры у женщин разного возраста

Исследование вагинальной экосистемы было инициировано Дёдерлейном, который в 1892 году описал лактобациллы (Lactobacilli). По мнению автора, только они составляют микрофлору нормального вагинального секрета. 

Свойства лактобацилл были описаны уч. Кертисом в 1914 году. ученый подтвердили их доминирующую роль в нормальных выделениях из влагалища, заявив, что во влагалище также обитают другие бактерии, как аэробные, так и анаэробные, но в гораздо меньшем количестве.   

Расширение знаний об экосистеме влагалища принесло исследование Круикшенка и Шармана, которые описали микрофлору влагалища: у плода в полости матки, новорожденных, девочек до менархе, женщин в репродуктивном периоде и в период менопаузы. 

Развитие микрофлоры влагалища в основном стимулируется эстрогенами. Внутри полости матки влагалище плода стерильно. В первые 2-3 недели послеродового периода микрофлора влагалища напоминает влагалищную среду взрослой женщины, что вызвано проникновением эстрогена матери через плаценту. 

У девочек до начала менструации во влагалищной среде можно обнаружить следующие бактерии:

• Staphylococcus epidermidis (21%);
• Diphteroides (21%);
• Bacteroides (19%);
• Peptococcus (19%);
• Porphyromonas (19%);
• Gardnerella vaginalis (12%). 

После менархе микрофлора влагалища снова стимулируется эстрогенами. В период постменопаузы микрофлора влагалища напоминает влагалищную среду у девочек препубертатного возраста.

По результатам исследований ученого Эшербаха, оказалось, что нормальная микрофлора влагалища женщин репродуктивного периода на 96% состоит из лактобацилл. Все палочки Lactobacillus окрашиваются грамположительно, не образуют спор, не продуцируют каталазу, но вырабатывают молочную кислоту в результате ферментации гликогена, содержащегося в клетках эпителия влагалища. 

Палочки Lactobacillus

Род Lactobacillus относится к факультативным бактериям, которые могут размножаться в аэробной и анаэробной среде. Отдельные виды Lactobacillus различаются по длине и ширине, иногда напоминают кокки. Существует более 50 видов лактобацилл. В нормальных выделениях наиболее часто встречаются: 

• L. acidophilus;
• L. plantarum;
• L. brevies;
• L. jensenii;
• L. caseii;
• L. salivarius;
• реже L. delbrueckii.

• ингибиторы протеаз;
• лактоцидин4
• перекись водорода (H 2 O 2);
• продуцируемый L. crispatus и L. jensenii, токсин, который подавляет размножение анаэробных бактерий. 

Было подсчитано, что 1 грамм нормальной ткани влагалища содержит 10 7 бактерий, а соотношение аэробных и анаэробных бактерий составляет 2:5.

Лактобактерии и их производство: молочная кислота, ингибиторы протеаз, лактоцидин, перекись водорода, а также другие аэробные и анаэробные бактерии, стимулирующие эстроген, создают правильную экосистему влагалища.

Таблица 1. Физиологическая микрофлора влагалища

Причины, возбудитель

Уреаплазмоз связан с повышенным содержанием или преобладанием в мочеполовой микрофлоре бактерий рода уреаплазм: Ureaplasma urealyticum и Ureaplasma parvum. Это условно-патогенные бактерии, которые в малых количествах наблюдаются в составе микрофлоры здоровых мужчин. Само по себе их обнаружение не является диагнозом и не требует лечения, однако высокое содержание уреаплазм в организме может быть признаком дисбиоза и увеличивает риск развития воспалений.

Дисбиоз может возникать по самым разным причинам. Спровоцировать изменения в составе нормальной микрофлоры могут:

• стресс,
• недостаток витаминов,
• сопутствующие инфекции,
• анемия,
• прием некоторых лекарств (например, антибиотиков),
• курение и алкоголь,
• недостаток питательных веществ,
• чрезмерное потребление сахара,
• недостаток клетчатки в составе рациона.

Сегодня ученые не могут прийти к единому мнению о том, насколько уреаплазмы опасны. Они могут участвовать в развитии ассоциированных воспалительных заболеваний, однако их роль до сих пор полностью не определена.

Есть данные, подтверждающие, что Ureaplasma urealyticum вместе с другим признанным патогеном из того же семейства Mycoplasma genitalium может вызвать негонококковый уретрит. Их выявляют также при:

• воспалительных изменениях шейки матки (цервитит) и влагалища (вагинит),
• воспалениях прямой кишки (проктит),
• воспалении горла (фарингит),
• заболеваниях органов малого таза,
• в более редких случаях — при воспалении почек (пиелонефрит).

При этом достоверно не известно, являются ли эти бактерии возбудителями названных инфекций.

Mycoplasma genitalium признана инфекцией, передающейся половым путем. Она требует скрининга и лечения обоих половых партнеров. Уреаплазмоз же врачи не лечат. Необходимо лечить ассоциированное воспалительное заболевание, которое развивается на фоне уреаплазмоза.

Пути передачи

Уреплазмы передаются половым путем: через вагинальный или оральный секс. Особенно рискуют люди, которые не используют презервативы. При этом эти бактерии часто сопровождают другие инфекции, передающиеся половым путем: хламидиоз, гонорея, сифилис. Они ослабляют иммунитет и усиливают риск ассоциированных воспалений.

Другой путь — вертикальный, от матери к ребенку. Бактерии могут проникнуть в организм ребенка через пуповину еще до рождения или во время родов.

Очень редко наблюдают бытовой путь передачи уреаплазм: через средства гигиены, общее полотенце или нижнее белье. Нужно понимать, что бактерия должна со слизистой влагалища или поверхности уретры попасть на полотенце, а затем на слизистую здорового человека. Притом, что уреаплазмы фактически не живут вне клетки хозяина. Поэтому возможность такой передачи чрезвычайно сомнительна.

Диагностика

Диагностика уреаплазм проводится при выраженных внешних симптомах воспалительного процесса, причиной которого могли стать эти бактерии. Например, затруднение и сильная боль при мочеиспускании, зуд и покраснение полового члена. Если у врача есть подозрение на наличие инфекций, передающихся половым путем (трихомониаз, генитальный герпес), он также назначает анализ на наличие уреаплазмы. У женщин эту диагностику проводят при планировании беременности, а также после выкидышей и при подозрении на бесплодие.

Уреаплазмы и преждевременные роды.

Врачи считают, что уреаплазмы не вызывают преждевременные роды. Но они могут сыграть свою роль в воспалительном инфекционном процессе, который может привести к родам до срока, инфекции оболочек плода и жидкости, воспалению пуповины, миграции плаценты, слишком малому весу новорожденного.

В обязательном порядке анализ на уреаплазмы сдают доноры спермы и пациенты, которым предстоит операция на органах мочеполовой системы, и в случае осложнений после пересадки почки.

К какому врачу обратиться

При наличии симптомов мужчинам нужно обращаться к дерматовенерологу или урологу, женщинам — к гинекологу. Как правило, врач сначала дает направление на анализы, передающиеся половым путем. Если результаты отрицательные, пациента просят сдать анализ еще и на уреаплазмы.

Какие анализы сдавать

В зависимости от метода на анализ направляют соскоб с уретры, прямой кишки, а также мочу, семенную жидкость и кровь. Так как уреаплазмы очень малы, микроскопией их выявить нельзя. Поэтому используют другие методы выявления уреаплазм.

Как подготовиться к анализам

В биоматериале, который получит лаборатория, должно содержаться достаточное количество бактерий. Перед походом к врачу следует:

воздержаться от походов в туалет хотя бы 3 часа (важно при взятии соскоба из уретры),
в течение 2 дней воздерживаться от половых контактов (важно при взятии эякулята и секрета простаты),
не есть минимум 5–6 часов перед анализом (важно при взятии крови).

Для исследования может потребоваться сдать среднюю порцию мочи. Собирать мочу нужно утром или как минимум через 2–3 часа после последнего мочеиспускания.

Все исследования следует проводить до начала приема антибактериальных препаратов.

Посев

Посев (микробиологический анализ) заключается во взятии биоматериала (выделений из уретры, семенной жидкости, мочи) и помещения его на питательную среду. Если бактерии в биоматериале присутствуют, они станут образовывать колонии. По времени этот анализ самый долгий, он занимает 5–7 дней, но считается самым достоверным способом для определения чувствительности бактерий к антибиотикам (антибиотикорезистентность). Также он дает информацию о титре бактерий. Титр выше 10 4 КОЕ на 1 мл скажет о наличии патологии. Все это поможет врачу определить наиболее подходящее лечение.

ПЦР

Самый популярный и наиболее чувствительный метод — метод ПЦР (полимеразная цепная реакция). В этом случае определяют наличие ДНК уреаплазм в образце взятого биоматериала. Если этот анализ даст положительный результат, есть большая вероятность того, что возбудитель инфекции — уреаплазмы.

Антитела в крови

Другой метод — метод ИФА (иммуноферментный анализ). Он определяет уровень антител к уреаплазме в крови из вены. Анализ делается натощак или через 5 часов после еды. Этот анализ говорит о том, что человек сталкивался с бактерией. Он может служить дополнительным подтверждением диагноза, но его результат не может быть поводом к началу лечения. Метод ИФА назначают только в совокупности с другими анализами.

Общий анализ мочи

В этом случае о наличии бактерий будут говорить увеличение числа лейкоцитов (лейкоцитоз) и присутствие бактерий в моче (бактериурия). При этом большинству пациентов с бессимптомной бактериурией лечение не назначают. Исключения составляют ситуации с высоким риском появления инфекции в мочеполовой системе. Например, при беременности, СПИДе, онкологическом заболевании, после операции по пересадке почки.

Мазки у мужчин

Так как при уреаплазмозе высокая концентрация уреаплазм у мужчин наблюдается на поверхности уретры, для исследования часто берут соскоб с ее поверхности. Инструментом в этом случае служит тонкий зонд с щеточкой на конце. Процедура может вызывать болевые ощущения, инструмент повреждает верхний слой эпителия. После взятия соскоба также возможна боль при мочеиспускании на протяжении 1-2 дней.

Роль в болезни

Морфология, биохимия и идентификация клеток

C. pseudotuberculosis — это грамположительные бактерии, которые могут быть кокковидными или нитчатыми палочками, которые могут быть организованы в палисады. Гранулы метахроматического волютина, содержащие фосфат, можно увидеть в форме палочек, но не в форме коккоида при окрашивании с использованием метода Альберта или Нейссера. Другие характеристики этой бактерии включают отсутствие споруляции, отсутствие капсул и наличие бугорков , однако они неподвижны.

Эти бактерии выращивают при 37 ° C в аэробных или анаэробных условиях, поэтому C. pseudotuberculosis является факультативным анаэробом. После инкубации на твердой среде в течение 48 часов он образует сухие бледно-желтые колонии диаметром 1-2 мм. Среда, содержащая сыворотку или цельную кровь, улучшает рост бактерий, и после 48–72 часов инкубации на кровяном агаре вокруг бактериальных колоний обычно образуется полоса бета- гемолиза . C. pseudotuberculosis образует комки в жидкой среде.

Хотя штаммы C. pseudotuberculosis одинаковы по своей морфологии и росту на среде, они демонстрируют большее разнообразие биохимических свойств, таких как способность к брожению . Хотя они не могут выделять газ, все штаммы могут использовать глюкозу , фруктозу , мальтозу , маннозу и сахарозу для производства кислоты. Дополнительные биохимические свойства этих бактерий включают положительные по фосфолипазе D и каталазе , отрицательные по оксидазе и бета-гемолитические свойства . Обычно существует два подтипа C. pseudotuberculosis : equi biovar поражает лошадей и крупный рогатый скот, а биовар ovis поражает мелких жвачных. Их способность снижать содержание нитратов можно использовать для различения подтипов. Оборудов биовар может уменьшить нитратов в то время как Ovis биовар вообще не может , однако, некоторые исключения были продемонстрированы. Коринеформные бактерии, включая C. pseudotuberculosis, также можно дифференцировать с помощью биохимического теста, называемого системой API Coryne, который включает тесты ферментации ферментов и углеводов и требует 24–48 часов для выполнения. Наконец, для подтверждения идентификации C. pseudotuberculosis можно использовать анализ генетической последовательности, если биохимической идентификации недостаточно. Фактически, был разработан анализ мультиплексной полимеразной цепной реакции с использованием ряда характерных генов, которые могут дифференцировать близкородственные виды коринебактерий, C. pseudotuberculosis, C. ulcerans и C. diphtheriae.

История, эпидемиология и зоонозный риск

Впервые C. pseudotuberculosis был выделен из лимфатического узла коровы в 1888 году французским бактериологом Эдмоном Нокаром . Вскоре после этого Хьюго фон Прейс   взял его образец из абсцессов у овцы , и бактерия была названа бациллой «Прейс-Нокарда» до дальнейшей работы немецких микробиологов в середине 1900-х годов, когда она была повторно классифицирована. в род Corynebacterium . В 1948 году он был окончательно переименован в Corynebacterium pseudotuberculosis , чтобы отразить, что клинические признаки заболевания были похожи на симптомы, вызываемые видами туберкулеза .

Распространение C. pseudotuberculosis в основном прослеживается при изучении распространенности казеозного лимфаденита , основного патологического заболевания бактерий. Заражение домашних овец и коз было обнаружено по всему миру. Несмотря на то, что в последнее время проведено немного исследований его распространенности, данные скотобойни в Австралии в конце 1980-х годов показали, что C. pseudotuberculosis поражает 50–60% овец. В 1983 году была разработана вакцина, которая была добавлена ​​к рекомендованным клостридиальным вакцинам для овец. В 2009 году средний национальный показатель распространенности в Австралии составлял 5,2%, хотя этот показатель варьируется в зависимости от региона. Распространенность среди канадских овец, в основном на основании данных о скотобойнях Альберты и Квебека, составляет от 8 до 36 процентов. C. pseudotuberculosis также вызывает заболевание у лошадей, и его следует рассматривать как распространенный в регионах, где были зарегистрированы случаи « голубиной лихорадки » и «язвенного лимфаденита».

Это заболевание распространяется между инфицированными животными, переносчиками и путем заражения окружающей среды экссудатом из абсцессов. Основное распространение бактерий происходит, когда поверхностные абсцессы вскрываются и выделяют выделения, с которыми затем контактируют другие животные во время ухода, или загрязняют корм, воду и подстилку, потребляемую другими животными. Эти абсцессы могут открываться самопроизвольно, либо на поверхности, либо во время разрезания. C. pseudotuberculosis может выживать в почве до 8 месяцев и заражать подстилку и внутренние помещения для обработки в течение нескольких недель. У лошадей членистоногие- переносчики считаются значительным источником инфекции. Поскольку векторные паттерны меняются с повышением температуры, в Соединенных Штатах вновь появляется «голубиная лихорадка».

Эта бактерия иногда вызывала инфекцию у людей, которые тесно сотрудничают с инфицированными мелкими жвачими животными, что приводит к аналогичному увеличению лимфатических узлов на шее и паху. Наиболее вероятный путь заражения — прямой контакт с инфицированным животным или его сырыми продуктами. Таким образом, в группе риска в основном сельскохозяйственные рабочие и ветеринары.

Патогенность и вирулентность

Диагностика

Диагностика C. pseudotuberculosis может быть затруднена из-за расплывчатых клинических признаков, таких как потеря веса и общая плохая бережливость. Для подтверждения заражения животных наружной формой необходимо взять бактериологический посев гнойного материала из интактного абсцесса. Также могут быть полезны биопсии. Если C. pseudotuberculosis изолирован, то это дает окончательный диагноз. Труднее подтвердить диагноз у животных, инфицированных внутренней формой заболевания, однако может оказаться полезным ультразвуковое исследование и / или рентгенография. ПЦР показала многообещающие результаты для диагностики, и существует также сэндвич-ELISA с двойными антителами, который можно использовать для овец и коз.